CNS一周论文推荐（2018.08.16）
科技君说
赶路的时候，总希望有人为自己留一盏灯，有光，有方向，有温暖。
《CNS一周论文推荐》，甄选《Cell》《Nature》《Science》三大刊中，与生命科学相关的文章，助您了解各种疾病、动植物、微生物的最新研究进展和技术突破，及时跟踪最新科研动态，期待成为您科研路上的一盏灯。
第11期解读，供您参考~
本期速览：
《Cell》-2018.08.09
1. 外周血淋巴细胞和肿瘤类器官的共培养可以产生肿瘤反应性T细胞
《Nature》-2018.08.08
2. Toll 样受体5对新生儿的选择作用会影响其长期肠道菌群的组成
3. 单细胞中的RNA速度
《Science》-2018.08.10
4. 对氧磷酶1(PON1)的古老趋同丢失对于现代海洋哺乳动物的潜在危险
5. 乳糜管结拉链结构可以防止饮食引起的肥胖
6. 得知患者因服药过量死亡可以减少医生开具阿片类药物
7. 人类肾脏单细胞转录组揭示了肾脏肿瘤的 “细胞身份”
《Cell》
1
标题：
Generation of Tumor-Reactive T Cells by Co-culture of Peripheral Blood Lymphocytes and Tumor Organoids
外周血淋巴细胞和肿瘤类器官的共培养可以产生肿瘤反应性T细胞
关键词：
类器官、免疫疗法、结直肠癌、非小细胞肺癌、T细胞
解读内容：
对于一部分患有上皮癌的患者来说，癌症免疫疗法已经展示出实质性临床活性。然而，目前缺乏可以用来研究个体患者癌症T细胞相互作用以及理解反应性决定因素的技术平台。因此该研究建立并验证了一个以个性化方式来诱导和分析肿瘤特异性T细胞对上皮癌的反应平台。该研究证明，自体肿瘤类器官和外周血淋巴细胞的共培养物，可用于富集来自患有错配修复缺陷的结直肠癌和非小细胞肺癌患者的外周血肿瘤反应性T细胞。此外，研究还证明了这些T细胞可用于评估杀死匹配的肿瘤类器官的效率。该平台提供了用于分离肿瘤反应性T细胞的无偏策略，并提供了用于评估个体患者中肿瘤细胞对T细胞介导攻击的敏感性方法。（解读：盛逸飞）
刊发时间：
2018.08.09
原文链接：
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(18)30903-6
《Nature》
2
标题：
Neonatal selection by Toll-like receptor 5 influences long-term gut microbiota composition
Toll 样受体5对新生儿的选择作用会影响其长期肠道菌群的组成
关键词：
TRL5、肠道微生物、新生阶段
解读内容：
肠道菌群的改变与几种非常常见的免疫介导疾病和代谢疾病有关，粪便移植实验已经表明，至少在某些情况下这种改变具有因果关系。新生儿阶段对于微生物群组成、宿主-微生物相互作用和免疫稳态的发展尤为关键。然而，新生儿启动时期的潜在分子机制尚未明确。本研究鉴定了一个宿主介导的细菌定植调节回路，该回路虽然仅在新生儿早期起作用，但是却会影响宿主终生的微生物群组成。研究发现，新生小鼠肠上皮细胞中鞭毛蛋白受体Toll样受体5（TLR5）的表达与年龄有关。利用竞争性定植实验，该团队证明了上皮TLR5介导的REG3γ产物对于定殖化鞭毛细菌的反向选择是至关重要的。另外，通过在新生的、成年野生型以及成年Tlr5缺陷的无菌小鼠中进行的菌群比较转移实验表明，新生小鼠TLR5的表达对于其整个生命周期中微生物群的组成都有很大影响。因此，以上结果表明成年宿主体内的有益菌群是在新生儿早期形成的。这也许可以解释为什么在生命早期干扰微生物群建立的环境因素会影响成年期的免疫稳态和健康。（解读：彭雪）
刊发时间：
2018.08.08
原文链接：
https://www.nature.com/articles/s41586-018-0395-5
3
标题：
RNA velocity of single cells
单细胞中的RNA速度
关键词：
RNA丰度、细胞动力学
解读内容：
RNA丰度是衡量单细胞状态的有力指标，单细胞RNA测序能够以高精度、高灵敏度和高通量的方式对RNA丰度进行定量。然而，这种方法只能揭示某个时间点静态的现象，对于分析诸如胚胎发育或者组织再生等动态现象却是一个巨大的挑战。本研究提出了RNA速度的概念，即基因表达状态的时间导数，它可以通过区分普通单细胞RNA测序中未剪切和剪切的mRNAs来直接估计。RNA速度是一个高维的矢量，它可以预测单个细胞在未来几个小时内的状态。文章验证了它在神经嵴谱中的准确性，展示了它在多个已发表的数据库和技术平台上的应用，揭示了发育中的小鼠海马的分支谱系树，并检验了人类胚胎大脑中的转录动力学。文章希望RNA速度能够在分析发育谱系和细胞动力学方面提供极大的帮助，尤其希望应用在人身上。（解读：赵书华）
刊发时间：
2018.08.08
原文链接：
https://www.nature.com/articles/s41586-018-0414-6
《Science》
4
标题：
Ancient convergent losses of Paraoxonase 1 yield potential risks for modern marine mammals
对氧磷酶1(PON1)的古老趋同丢失对于现代海洋哺乳动物的潜在危险
关键词：
海洋哺乳动物、PON1、趋同丢失、潜在危险
解读内容：
哺乳动物通过在完全不同的环境中定居而变得多样化，而每次的转变都会引起其大量的分子改变，如蛋白功能的丢失等。虽然最初这些丢失并不会带来危害，但在之后则可能会逐渐引发危害的产生。本研究使用系统发育分析方法，在独立的海洋哺乳动物物种中鉴定了可能的趋同功能丢失事件。在一个极端的例子中，对氧磷酶1 (PON1)在所有海洋物种中都累积了损伤突变，而在所有陆地哺乳动物中则保持完整；并且这些突变的积累与海洋物种血浆中PON1酶活性的丧失一致。这种趋同丢失可能是由于海洋哺乳动物祖先的脂质代谢和（或）在脂肪酸氧化中影响PON1功能的血流氧化环境的同时改变引起的。另外，研究发现，PON1功能的丢失也使得海洋哺乳动物失去了对特定人造有机磷化合物神经毒性的主要防御，这意味着在现代环境中，出现了海洋哺乳动物需要面对的潜在危险。（解读：刘青峰）
刊发时间：
2018.08.10
原文链接：
http://science.sciencemag.org/content/361/6402/591
5
标题：
Lacteal junction zippering protects against diet-induced obesity
乳糜管结拉链结构可以防止饮食引起的肥胖
关键词：
饮食、肥胖
解读内容：
肥胖是个全球性的健康问题，饮食中过量摄入油脂会导致肥胖。肠细胞吸收的脂质会被包装到乳糜微粒中，乳糜微粒则会通过乳糜管（一种肠淋巴管）进入血液。研究发现通过诱导内皮基因中神经纤毛蛋白1（Nrp1）和血管内皮生长因子受体1（Vegfr1）的缺失，可以使老鼠避免饮食性肥胖。Nrp1和Vegfr1的缺失会增加VEGF-A的生物有效性以及Vegfr2信号的传导能力，从而诱导乳糜管形成拉链结构来减少乳糜微粒的摄入。在突变个体中，通过抑制Vegfr2和血管内皮（VE）-钙粘蛋白信号可以恢复乳糜微粒的运输；在野生型个体中通过拆解细胞骨架VE-钙粘蛋白锚定点建立的乳糜管拉链结构可以防止乳糜微粒的摄入。这些数据表明乳糜管结可能是预防饮食性肥胖的关键点。（解读：彭丹）
刊发时间：
2018.08.10
原文链接：
http://science.sciencemag.org/content/361/6402/599
6
标题：
Opioid prescribing decreases after learning of a patient’s fatal overdose
医生在得知病人因用药过量死亡后会减少阿片类处方的开具
关键词：
阿片类药物处方、过量用药
解读内容：
大多数因为阿片类药物处方成瘾而死亡的人，都是在合法获得该药以治疗普通疾病后发生的，而对于这些人来说，使用阿片类药物的风险要远远大于其益处。心理学家为此提供了一个解释：人们可能会在没有丰富的个人经验的情况下，认为用药的风险较低；在没有观察到风险高的情况下用药可能不如预期的那么小心；并且在没有权威禁令的情况下可能继续用药。为了检验这些假设，研究者对861名临床医生进行了一项随机对照试验，这些临床医生为170名患者开了阿片类药物处方，随后这些病人都因药物过量而死亡。临床医生被分为两组，对照组和干预组。干预组的临床医生收到了他们病人的死亡通知和他们县的体检医师的安全处方禁令，而对照组的医生却没有。在干预后3个月内，接收到县体检医生的来信的干预组比对照组患者填写的处方中的吗啡量减少了9.7％。研究者还观察到信件接收者启用阿片类药物及高剂量阿片类药方的数量都有所减少。（解读：张海琳）
刊发时间：
2018.08.10
原文链接：
http://science.sciencemag.org/content/361/6402/588
7
标题：
Single-cell transcriptomes from human kidneys reveal the cellular identity of renal tumors
人类肾脏单细胞转录组揭示了肾脏肿瘤的 “细胞身份”
关键词：
肾肿瘤、单细胞转录组、信号通路
解读内容：
细胞的功能和表型由mRNA编码。在人类癌症中，mRNA可以表明恶性肿瘤细胞的身份和肿瘤组织的多样性。本研究对来自胎儿、儿童和成人的72,501个肾肿瘤和正常肾脏组织样本的单细胞转录组进行了探究分析。研究者发现儿童期Wilms肿瘤能够与特定类型的胎儿细胞相匹配，从而为Wilms肿瘤细胞来源于异常胎儿细胞的假说提供证据。而在成人肾细胞癌中，研究者发现典型的癌转录组与一个目前知之甚少的近曲肾小管细胞亚型相匹配。最后，通过肿瘤成分的分析确认了与癌症相关的正常细胞，并展现了复杂的血管内皮生长因子（VEGF）的信号通路。总之，该研究的结果揭示了人类肾脏肿瘤的确切“细胞身份”和组成。（解读：傅涛）
刊发时间：
2018.08.10
原文链接：
http://science.sciencemag.org/content/361/6402/594
审核：刘青峰、李瑜琪
编辑：市场部
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